Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SfswapQ3USH5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SfswapQ3USH5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms