Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brf2Q3UAW9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brf2Q3UAW9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms