Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q08AU9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q08AU9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q08AU9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q08AU9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q08AU9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q08AU9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q08AU9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q08AU9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q08AU9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q08AU9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q08AU9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q08AU9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q08AU9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q08AU9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q08AU9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q08AU9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q08AU9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q08AU9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q08AU9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q08AU9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q08AU9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q08AU9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q08AU9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q08AU9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q08AU9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q08AU9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q08AU9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q08AU9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q08AU9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms