Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MitfQ08874 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MitfQ08874 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MitfQ08874 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MitfQ08874 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MitfQ08874 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MitfQ08874 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MitfQ08874 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MitfQ08874 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MitfQ08874 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MitfQ08874 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MitfQ08874 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms