Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bop1P97452 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Bop1P97452 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bop1P97452 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bop1P97452 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bop1P97452 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Bop1P97452 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bop1P97452 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bop1P97452 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms