Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Psme1P97371 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psme1P97371 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Psme1P97371 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Psme1P97371 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Psme1P97371 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Psme1P97371 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psme1P97371 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psme1P97371 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psme1P97371 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Psme1P97371 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psme1P97371 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psme1P97371 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Psme1P97371 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psme1P97371 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms