Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgd1P52734 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fgd1P52734 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms