Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psen1P49769 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psen1P49769 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psen1P49769 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psen1P49769 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms