Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TfamP40630 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TfamP40630 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TfamP40630 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TfamP40630 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TfamP40630 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TfamP40630 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TfamP40630 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TfamP40630 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TfamP40630 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TfamP40630 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TfamP40630 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TfamP40630 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TfamP40630 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TfamP40630 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TfamP40630 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TfamP40630 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TfamP40630 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TfamP40630 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TfamP40630 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TfamP40630 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TfamP40630 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TfamP40630 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TfamP40630 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TfamP40630 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TfamP40630 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TfamP40630 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TfamP40630 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TfamP40630 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TfamP40630 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TfamP40630 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TfamP40630 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TfamP40630 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TfamP40630 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TfamP40630 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TfamP40630 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TfamP40630 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TfamP40630 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TfamP40630 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TfamP40630 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TfamP40630 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TfamP40630 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TfamP40630 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TfamP40630 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TfamP40630 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TfamP40630 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TfamP40630 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TfamP40630 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TfamP40630 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TfamP40630 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TfamP40630 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TfamP40630 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TfamP40630 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TfamP40630 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TfamP40630 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TfamP40630 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TfamP40630 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TfamP40630 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TfamP40630 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TfamP40630 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TfamP40630 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TfamP40630 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TfamP40630 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TfamP40630 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TfamP40630 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms