Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acvr1P37172 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 858.8 ms