Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Kif3aP28741 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kif3aP28741 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kif3aP28741 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms