Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RhoP15409 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhoP15409 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoP15409 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoP15409 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoP15409 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoP15409 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoP15409 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoP15409 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoP15409 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoP15409 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoP15409 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoP15409 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoP15409 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoP15409 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoP15409 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoP15409 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoP15409 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhoP15409 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RhoP15409 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RhoP15409 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RhoP15409 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhoP15409 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhoP15409 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhoP15409 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoP15409 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoP15409 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoP15409 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoP15409 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoP15409 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoP15409 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoP15409 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoP15409 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoP15409 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoP15409 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoP15409 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhoP15409 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoP15409 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoP15409 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoP15409 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoP15409 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoP15409 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoP15409 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoP15409 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoP15409 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoP15409 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoP15409 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoP15409 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoP15409 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoP15409 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhoP15409 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoP15409 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoP15409 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoP15409 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoP15409 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoP15409 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoP15409 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoP15409 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoP15409 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoP15409 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoP15409 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoP15409 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoP15409 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoP15409 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoP15409 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoP15409 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoP15409 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoP15409 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoP15409 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoP15409 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoP15409 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoP15409 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoP15409 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoP15409 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoP15409 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoP15409 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoP15409 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoP15409 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoP15409 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoP15409 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoP15409 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoP15409 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoP15409 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoP15409 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoP15409 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoP15409 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoP15409 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoP15409 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoP15409 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoP15409 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoP15409 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoP15409 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoP15409 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms