Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc4a4O88343 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.9 ms