Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac1O09106 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.2 ms