Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm20828J3KMI7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Gm20828J3KMI7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms