Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8444F6XS56 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 222.4 ms