Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610001J05RikF2Z3Y9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150 ms