Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC11□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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