Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Knop1Q9Z2Q2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms