Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubl3Q9Z2M6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms