Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Gpc1Q9QZF2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc1Q9QZF2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
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Gpc1Q9QZF2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Gpc1Q9QZF2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc1Q9QZF2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.1 ms