Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms