Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl28Q9JIL2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms