Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
OtofQ9ESF1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
OtofQ9ESF1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OtofQ9ESF1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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