Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx6Q9ER75 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms