Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubiad1Q9DC60 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubiad1Q9DC60 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms