Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtpbp4Q99ME9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms