Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrit1Q8K099 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrit1Q8K099 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrit1Q8K099 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrit1Q8K099 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrit1Q8K099 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrit1Q8K099 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrit1Q8K099 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms