Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lancl3Q8CD19 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lancl3Q8CD19 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms