Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc30Q8BVF4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms