Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.6Q85ZW5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.6Q85ZW5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.6Q85ZW5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.6Q85ZW5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.6Q85ZW5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms