Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn2Q6PHP6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn2Q6PHP6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms