Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ecm29Q6PDI5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ecm29Q6PDI5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ecm29Q6PDI5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms