Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zbtb40Q6PCS8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zbtb40Q6PCS8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb40Q6PCS8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms