Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2surpQ6NV83 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2surpQ6NV83 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms