Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ScapQ6GQT6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ScapQ6GQT6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms