Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Knl1Q66JQ7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Knl1Q66JQ7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Knl1Q66JQ7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms