Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb6Q60692 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms