Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms