Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psme4Q5SSW2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psme4Q5SSW2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme4Q5SSW2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms