Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam228bQ497Q6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam228bQ497Q6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms