Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SfswapQ3USH5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SfswapQ3USH5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms