Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mex3cQ05A36 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mex3cQ05A36 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mex3cQ05A36 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mex3cQ05A36 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mex3cQ05A36 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mex3cQ05A36 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mex3cQ05A36 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mex3cQ05A36 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mex3cQ05A36 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mex3cQ05A36 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mex3cQ05A36 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mex3cQ05A36 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mex3cQ05A36 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mex3cQ05A36 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mex3cQ05A36 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mex3cQ05A36 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mex3cQ05A36 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mex3cQ05A36 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms