Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r236Q05A06 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms