Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Xrn1P97789 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Xrn1P97789 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Xrn1P97789 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Xrn1P97789 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Xrn1P97789 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Xrn1P97789 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Xrn1P97789 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Xrn1P97789 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Xrn1P97789 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Xrn1P97789 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Xrn1P97789 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Xrn1P97789 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Xrn1P97789 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Xrn1P97789 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms