Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl9P51670 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.9 ms