Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb41P48193 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb41P48193 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb41P48193 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb41P48193 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb41P48193 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb41P48193 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb41P48193 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb41P48193 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epb41P48193 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epb41P48193 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb41P48193 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epb41P48193 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms