Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rom1P32958 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rom1P32958 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rom1P32958 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rom1P32958 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rom1P32958 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rom1P32958 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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