Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnga1P29974 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms