Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp1P29452 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp1P29452 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp1P29452 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp1P29452 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp1P29452 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp1P29452 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Casp1P29452 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp1P29452 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms